有的農戶用病豬住過的豬圈再養豬，結果豬再次發病，甚至死亡，損失嚴重。為此，必須將圈舍消毒後再養豬。消毒方法如下：
1.豬舍消毒。先將圈舍清掃幹淨，再用20%的石灰乳或3%的熱燒堿水、20%的漂白粉進行消毒。消毒的次序為牆壁、圈欄、門窗、食槽、地麵、用具及門口地麵。消毒藥水可用掃帚塗刷;最好用噴霧器噴灑。消毒完畢，豬圈設有門窗的應關閉2至3小時再打開，同時將食槽及地麵用清水衝洗幹淨。
2.土壤消毒。泥土地麵應先消除糞便、墊草等汙物，然後再將上麵的一層泥土鏟除，最後用20%的漂白粉或20%的石灰乳、3%熱燒堿水澆灑。
3.糞便及汙水消毒。少量的糞便、墊草等可以深埋。糞便的數量如果較多，可用發酵法來消毒。方法是：在離豬舍稍遠的地方，在地麵挖一淺溝，深約40厘米，寬約2米，長度視糞便多少而定。底部先鋪健康豬糞一層，然後將病豬糞堆上，在病豬糞上邊再蓋一層健康豬糞及雜草，最後用稀泥密封。病豬糞很稀時，可添加幹土或幹碎草，太幹時可加入適量水，使其迅速發酵。夏秋約1個月，冬春約2個月，即可達到消毒的目的。
病豬舍的汙水，數量較少時可澆在糞便內一起發酵消毒;數量很多時可在汙水總量中加入2%的生石灰粉或0.2%的漂白粉進行消毒。
